Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF22A3QJZ6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms