Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms