Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHLDA3Q9Y5J5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms