Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms