Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms