Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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