Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNPO2Q9UMS6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms