Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BARX2Q9UMQ3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BARX2Q9UMQ3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms