Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2AQ9ULE3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms