Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBE1Q9UJT0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms