Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms