Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms