Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms