Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms