Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXL2Q9NZ53 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms