Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms