Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms