Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATAD3AQ9NVI7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms