Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMBRD1Q9NUN5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms