Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms