Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEC31BQ9NQW1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEC31BQ9NQW1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEC31BQ9NQW1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC31BQ9NQW1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC31BQ9NQW1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC31BQ9NQW1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC31BQ9NQW1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC31BQ9NQW1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC31BQ9NQW1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC31BQ9NQW1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC31BQ9NQW1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC31BQ9NQW1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC31BQ9NQW1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC31BQ9NQW1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC31BQ9NQW1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC31BQ9NQW1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC31BQ9NQW1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC31BQ9NQW1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC31BQ9NQW1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC31BQ9NQW1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC31BQ9NQW1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC31BQ9NQW1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC31BQ9NQW1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC31BQ9NQW1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC31BQ9NQW1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC31BQ9NQW1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC31BQ9NQW1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC31BQ9NQW1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC31BQ9NQW1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC31BQ9NQW1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC31BQ9NQW1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC31BQ9NQW1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC31BQ9NQW1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC31BQ9NQW1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC31BQ9NQW1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC31BQ9NQW1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC31BQ9NQW1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms