Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms