Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms