Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms