Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms