Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms