Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLMPQ9H6B4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms