Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLSTN2Q9H4D0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms