Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFDQ9GZP0 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms