Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms