Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PCGF6Q9BYE7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms