Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms