Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOL6Q9BWW8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms