Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCMBPQ9BTE3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms