Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms