Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms