Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms