Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms