Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CELF6Q96J87 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CELF6Q96J87 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CELF6Q96J87 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CELF6Q96J87 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CELF6Q96J87 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CELF6Q96J87 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CELF6Q96J87 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CELF6Q96J87 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CELF6Q96J87 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CELF6Q96J87 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CELF6Q96J87 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CELF6Q96J87 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CELF6Q96J87 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CELF6Q96J87 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CELF6Q96J87 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CELF6Q96J87 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CELF6Q96J87 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms