Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTERF3Q96E29 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms