Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EAF2Q96CJ1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms