Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4CQ96CF2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms