Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms