Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms