Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms