Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms