Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPBAR1Q8TDU6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms