Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC197Q8NCU1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms