Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRACR2BQ8N4Y2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.5 ms