Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms